Baku Yorozu adalah agen tak terkalahkan yang menggunakan kemampuannya dalam mimpi sadar untuk menyelamatkan Nemu, seorang selebriti nasional, dan menyelesaikan misi-misi sulit dalam mimpinya. Suatu malam, Baku tiba-tiba diserang oleh monster bernama Nightmare. Dalam mimpi sadarnya, Baku bertarung melawan musuh-musuh yang tak terkalahkan, tetapi entah mengapa, ia tidak mampu mengalahkan Nightmare dan melarikan diri. Baku, yang terdesak, bertemu dengan seorang sosok misterius yang memercayakan padanya Zeztz Driver dan Capsems, dan ia bertransformasi menjadi Kamen Rider Zeztz!

Dalam mimpi, Baku entah bagaimana menjadi seorang penjahat buronan. Ketika ia bertemu dengan Bomb Nightmare, ia berubah menjadi Zeztz, tetapi Nightmare berhasil melarikan diri. Suatu malam, Baku tiba-tiba dipanggil oleh Zero, yang memberinya perintah untuk "menyusup ke mimpi orang lain dan mencegah mimpi buruk Nightmare sebelum terjadi." Ini berarti ia harus menghentikan si pembom... Misi Baku untuk melindungi "tuan mimpinya" pun dimulai!

Setelah menerima perintah dari Zero, Baku tertidur dan menyusup ke mimpi buruk Fujimi untuk mencari pintu menuju pikiran Fujimi. Namun, Bomb Nightmare menyebabkan ledakan di depan mata Baku. Jika ini terus berlanjut, mimpi buruk Fujimi akan menjadi kenyataan!? Baku berubah menjadi Zeztz untuk menyelamatkan Fujimi dan dunia!

Baku bermimpi bahwa dia sedang menjaga seorang VIP, ayah dari pengantin wanita, dalam sebuah gladi resik pernikahan. Kemudian seorang pria muncul dan mencoba mencuri dari pengantin wanita, Miyuki. Perlindungan Baku menyelamatkan situasi, tetapi apakah dia adalah pemimpi dari Nightmare? Pada hari pernikahan, Baku, yang sedang menjaga pernikahan dalam mimpinya, dihadapkan pada Nightmare yang mengejar Miyuki. Baku berubah menjadi Zeztz, dan dengan kekuatan baru yang dia dapatkan dari Zero, dia menantang Nightmare untuk bertarung...!?

Mengapa pengantin wanita Miyuki menjadi pemimpi? Baku, yang terus mengumpulkan informasi di dunia nyata, bertemu dengan Miyuki yang berdiri di depan sebuah pohon besar di taman. Dia mengetahui bahwa Miyuki memiliki ingatan tentang pohon tersebut yang dapat mengubah hidupnya. Di dunia mimpi, Baku menemukan Pintu Pikiran Miyuki dan melihat pemandangan tak terduga di balik pintu tersebut. Crow Nightmare muncul lagi dan menyerang Miyuki dan semua orang!

Baku ditugaskan untuk sebuah misi baru: melarikan diri dari penjara. Baku mencoba melarikan diri bersama Nem, Masumi Bijogi dan Reiko, yang terjebak dalam mimpi buruk penjara, tetapi jalan mereka terhalang oleh berbagai jebakan. Dan rahasia apa yang tersembunyi dalam hubungan antara Nem dan Bijogi? Nox muncul di depan Baku dan dengan menakutkan berkata, "Ini adalah penjara kematian yang tak terhindarkan." Akankah Baku mampu menjalankan misinya yang tak tertembus?

Dalam mimpi yang terkurung di dalam penjara, sang penguasa mimpi, Bijogi, membawa Nem dan menghilang. Terheran-heran dengan perilaku aneh ini, Fujimi dan Nasuka mengungkapkan suatu "kebenaran kejam" kepada Baku. Setelah mengetahui semuanya, Baku kembali ke dunia mimpi dan mengambil misi baru untuk menyelamatkan Bijogi dan Nem. Namun sekali lagi, Nox menghalangi jalan Baku...!

Baku menyusup ke restoran tradisional "Royal Shirogane" dalam sebuah mimpi untuk menjalankan misi menghancurkan senjata biologis. Tepat di depan mata Baku yang waspada, Chef Shiomi, yang telah mencicipi hidangan sang pemilik restoran, Sannoh, pingsan. Setelah bangun, Baku mengunjungi restoran Sannoh, di mana insiden keracunan makanan yang tidak dapat dijelaskan terjadi. Mungkinkah itu senjata biologis lagi? Apakah sifat sebenarnya dari mimpi buruk itu...!?

Mimpi buruk apa yang diinginkan Chef Sannoh? Baku menemukan petunjuk dalam kata-kata Shiomi dan yang lainnya di dunia nyata, menemukan Pintu Pikiran ketiga Sannoh dalam mimpi. Mengintip ke dalam...! Sementara Fujimi dan yang lainnya berusaha keras untuk menghentikan pertemuan puncak, Baku berubah menjadi Zeztz dan bertabrakan dengan Poison Nightmare. Namun kemudian, Nox muncul kembali...!

Baku, yang ditugaskan dengan misi "Mengembalikan rahasia negara", menyusup ke rumah kolektor seni Atsumi dalam mimpi. Sebuah pencurian terjadi yang melibatkan lukisan terkenal dari koleksi Atsumi, dan Baku mencurigai rahasia negara tersembunyi di dalam lukisan tersebut. Namun, saat Baku mengejar pelaku, Nox muncul dan memperingatkannya, "Mengetahui terlalu banyak bisa menghancurkanmu." Seolah-olah dalam sekejap, Baku terkena pukulan dari senjata Nox...!?

Karya masterpiece yang dicuri dalam mimpi telah rusak parah oleh Nightmare. Rahasia negara yang tersembunyi di dalam lukisan itu akan tetap tidak terungkap jika ini terus berlanjut... Baku merasa putus asa, tetapi Zero menegurnya dengan nada yang tidak biasa keras. Baku sekali lagi berubah menjadi Zeztz dalam mimpi. Saat dia meraih Wonder Capsem untuk melindungi Atsumi dari Mold Nightmare...!?

Dalam mimpinya, Baku menjadi karyawan di Pusat Antariksa. Misi barunya: melindungi Bumi dari meteor raksasa yang mendekat. Waktu hingga tabrakan: 48 jam. Setelah bangun, Baku memberitahu Fujimi dan Nagumo tentang kiamat yang akan menimpa umat manusia dan segera bertindak. Kembali ke dunia mimpi, Baku berusaha mencegah tabrakan asteroid bersama Nem. Namun, di sana, Nox menghalangi jalan mereka. Di hadapan mereka, Nox mengenakan ikat pinggang, memuat Capsem, dan...!

Setelah bertarung melawan Nox Knight dan merasakan ketidakberdayaannya sendiri secara mendalam, Baku, yang telah kehilangan kepercayaan dirinya sebagai agen, dinyatakan tidak layak oleh Zero. Meskipun begitu, percakapan santai dengan Seiya membuatnya kembali mempertimbangkan dirinya sendiri. Dalam mimpi, ia menemukan Pintu Pikiran Seiya. Dengan Capsem baru, ia menghadapi Nox!

Misi baru Baku adalah menghabisi musuhnya, Nox. Berjalan-jalan melalui lubang hitam dalam mimpinya, Baku mulai mengingat kembali mimpi buruk yang pertama kali dia lihat saat masih anak-anak. Baku muda menghadiri sekolah bimbingan belajar. Mengikuti gerakannya, instruktur sekolah bimbingan belajar Nox muncul! Terkejut dengan pertemuan masa lalunya dengan Nox, Baku menantangnya, putus asa untuk mengembalikan kenangan yang terhapus!

Apa jenis organisasi CODE? Ketika Baku menanyai Zero, dia mengetahui bahwa Nox pernah menjadi agen CODE. Nem melaporkan kepada Baku bahwa dia dapat melihat melalui mimpi buruk Nox. Menyadari segala hal, Baku kembali menghadapi Nox dan berubah menjadi Zeztz menggunakan Capsem baru...!

Misi baru Baku adalah menyelamatkan Nem, yang diculik oleh Nightmare. Zero menuduh Baku sebagai "pengkhianat organisasi" karena membiarkan Nox melarikan diri. Meskipun Baku telah kehilangan kepercayaan, dia berusaha keras untuk menyelesaikan misi. Sementara itu, mengabaikan nasib Baku, Nox menghadapi Zero, memasang Driver baru, dan memuat Capsem!

Meskipun kehilangan Zero, Baku tetap melanjutkan misinya untuk menyelamatkan Nem. Perawat Haru kemudian mengungkapkan kebenaran mengejutkan tentang hilangnya Nem kepada Baku. Setelah menemukan Pintu Pikiran si Pemimpi, Baku mulai mengejar Wolf Nightmare. Namun, Nox menghalangi jalannya dan berubah menjadi Kamen Rider Nox. Baku juga berubah menjadi Zeztz, dan kedua Rider akhirnya bertarung!

Dalam mimpinya, Baku, yang kini menjadi siswa SMA, harus melindungi teman sekelasnya—Nasuka dan Kureha dari Nightmare yang mengatur permainan maut. Saat para siswa terjatuh, Kureha mengambil senjata dan menantang Nightmare untuk bertarung. Melihat Baku ikut campur, Kureha bergumam, "...Seven." Mengapa Kureha tahu nama itu...!?

Baku bertemu dengan Kureha yang kini menjadi jurnalis, dan mengetahui rahasia organisasi CODE. Terkejut, Baku mempertanyakan perannya sebagai agen dalam pertempuran. Nem mengaku kepada Baku bahwa Nightmare mungkin berasal dari alam bawah sadarnya sendiri. Menenangkan Nem yang sedang berduka, Baku dengan tegas menghadapi Nightmare Permainan Kematian saat ia menyerang lagi!

Dalam mimpinya, Baku, yang kini menjadi Village Person A, memulai petualangan bergaya RPG bersama Sota, Tomoko, dan sang pahlawan Nem untuk mengalahkan monster. Ketika Baku bertemu dengan Nightmare, ia berubah menjadi Zeztz, namun merasa tidak nyaman dengan perilaku aneh Nightmare... Sementara itu, Nox berhadapan dengan Six, yang muncul untuk menghabisi pengkhianat. Dia berubah menjadi Rider dan menantangnya untuk bertarung, tetapi...!?

Apakah ribuan anak-anak sedang bermimpi yang sama? Baku, yang mulai menyelidiki, menemukan benang merah di antara anak-anak yang mengalami mimpi yang sama. Masuk kembali ke dunia mimpi, Baku menyaksikan akhir yang mengerikan dari mimpi buruk yang terjadi di balik Pintu Pikiran. Anak-anak dalam bahaya! Baku berubah menjadi Zeztz dan menantang Baby Nightmare untuk bertarung, tetapi...!?

Misi baru adalah mengalahkan Disaster Nightmare yang muncul di dunia nyata dan mengambil nyawa Odaka. Merasa tidak percaya pada CODE yang kejam, Baku mempertanyakan perannya sebagai agen. Sementara itu, Five dan Six berhadapan dengan Disaster Nightmare dan Nox. Menyaksikan pertempuran sengit mereka, Baku tiba-tiba merasakan ada yang tidak beres!?

Baku, setelah berhasil mengembalikan transformasi Zeztz Catastrom dan mengalahkan Nox, tertidur lelap dan memasuki alam bawah sadar. Di sana, ia mengetahui perasaan mendalam yang dibawa oleh Nem, dan Baku sendiri bertekad untuk mengambil tindakan yang tegas. Akhirnya terbangun dari tidurnya, Baku dengan dingin menyatakan kepada Minami dan yang lainnya sebelum memulai misinya. "Saya adalah Code Number: Seven. Saya akan melaksanakan misi saya..." Apa yang telah mengubah Baku menjadi pria yang kejam ini? Dan ke mana dia akan pergi?

Agen tanpa ampun, Code Number: Seven, Baku, mengabaikan upaya Minami dan yang lainnya untuk menghentikannya dan berangkat untuk melaksanakan misinya: "Temukan Nem." Baku bergegas menemui Nem, yang telah terbangun dari mimpinya. Di tengah situasi ini, The Lady memanipulasi sebuah Nightmare untuk menyerang markas CODE. Kemudian, Three muncul, berubah menjadi Lord Three...!!

Baku terbangun di tempat tidur rumah sakit dan menyadari bahwa semua pengalamannya hanyalah mimpi. Tapi jika itu mimpi, mengapa Zeztz Driver dan Capsems ada di sini...? Bingung, Baku tertidur dan bertemu kembali dengan Nem dalam mimpinya. Apakah semua pengalamannya hanyalah mimpi buruk, atau...!?

Dalam mimpinya, Baku menceritakan pengalaman mengerikan yang dialaminya kepada Fujimi, Nasuka, dan Minami. Nox juga diam-diam mendengarkan cerita Baku ketika Five dan Six, yang bertindak atas perintah CODE, tiba-tiba muncul! Keempatnya bertarung, tetapi kemudian terjadi gangguan baru!?

Di tengah serangan gencar dari seorang Rider misterius yang muncul entah dari mana, Baku terbangun dari mimpinya. Siapakah orang yang mampu mengubah masa depan ini? Baku pun menugaskan dirinya sendiri untuk "mengungkap identitas asli musuh tersebut." Sementara itu, di CODE, Zero dan Three semakin cemas dengan kemunculan "Sieg." Siapakah sebenarnya "Sieg"…!?

Karena terus diganggu oleh Sieg, Baku mendatangi Nox untuk mencoba mengungkap identitas asli Sieg. Sementara itu, di CODE, Three sedang mempertimbangkan untuk mengerahkan "Code: Somnia," senjata pamungkas CODE. Di tengah situasi ini, Baku kembali berhadapan dengan Sieg dan menyatakan, "Akulah yang akan menghancurkan mimpi buruk ini," sambil menantangnya untuk bertarung!

Baku bertemu Minami, yang kini telah menjadi agen, dalam mimpi. Baku membantu Minami dalam misinya mencari kucing yang hilang, tetapi mereka diserang oleh seorang Nightmare, dan Baku pun terbangun. Telah terjadi sebuah "Kasus Hitam" di mana Minami tumbuh ekor kucing. Ketika Baku tertidur lagi, ia menantang Nightmare untuk bertarung demi menyelamatkan Minami, tapi...!

Minami adalah seorang agen CODE... Setelah mengetahui kebenarannya, Baku merasa kecewa dan marah, karena menyadari bahwa Minami selama ini hanya "berpura-pura menjadi bagian dari keluarga." Dalam mimpinya, Minami kembali berubah menjadi Cat Nightmare. Baku berubah menjadi Zeztz Catastrom dan, meski mengetahui identitas aslinya, ia justru menyerang Cat Nightmare...!?

"Kamu akan dihabisi oleh CODE..." Setelah menerima vonis kejam dari Zero, Baku menyusup ke dalam mimpi Zero. Diserang oleh Zeztz hitam yang misterius, Baku terpaksa menghadapi kebenaran yang mengerikan! Sementara itu, Sieg, yang berencana memanfaatkan Nem, memancingnya masuk ke Penjara Nightmare. Diteror oleh Nightmare yang tak terhitung jumlahnya, Nem pun terjebak di sudut oleh Sieg...!?

Zero, ayah kandungnya, telah memanfaatkan putranya, Baku, demi kepentingan Zeztz. Tak sanggup menerima nasib kejam yang menimpanya, Baku merasa tersiksa karena tak mampu memahami niat sebenarnya dari Zero. Akankah Baku mampu mengatasi mimpi buruk ini…!?

Sieg mengubah mimpi buruk Nem menjadi mimpi yang menjadi kenyataan, sehingga Nightmare pun muncul di dunia nyata. Melihat orang-orang diserang oleh Nightmare, Baku mengenakan Zeztz Driver-nya yang rusak. Dia memasukkan Capsem dan mencoba bertransformasi menjadi Zeztz, tapi…!?