Berikut daftar perguruan tinggi di Jawa Timur yang dikelola oleh Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia (PTN),^[1] Kementerian Agama (PTKN),^[2] serta perguruan tinggi yang dioperasikan oleh Kementerian/Lembaga non-Kementerian yang terdaftar dalam pangkalan data pendidikan tinggi Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi (Ditjen Dikti).^[3] Daftar ini merujuk pada Undang-undang Nomor 20 Tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional, perguruan tinggi dapat berbentuk Universitas, Institut, Sekolah Tinggi, Politeknik, atau Akademi. Secara keseluruhan terdapat 36 perguruan tinggi negeri di Jawa Timur. 14 perguruan tinggi berbentuk Universitas, 1 perguruan tinggi berbentuk Institut, 15 perguruan tinggi berbentuk Politeknik, 2 perguruan tinggi berbentuk Sekolah Tinggi, dan 4 perguruan tinggi berbentuk Akademi.

Kode PT	Logo	Nama	Singkatan	Tahun Berdiri	Lokasi	Akred.[4]	Tautan
001004		Universitas Airlangga	UNAIR	1954	Kota Surabaya	Unggul	[1]
001019		Universitas Brawijaya	UB	1963	Kota Malang	Unggul	[2]
001025		Universitas Jember	UNEJ	1964	Kabupaten Jember	Unggul	[3]
001033		Universitas Negeri Malang	UM	1954	Kota Malang	Unggul	[4]
001039		Universitas Negeri Surabaya	UNESA	1964	Kota Surabaya	Unggul	[5]
001043		Universitas Trunojoyo Madura	UTM	2001	Kabupaten Bangkalan	Unggul	[6]
001059		Universitas Pembangunan Nasional "Veteran" Jawa Timur	UPNVJT	1959	Kota Surabaya	Unggul	[7]
201003		Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim	UIN Malang	1957	Kota Malang	Unggul	[8]
201007		Universitas Islam Negeri Sunan Ampel	UINSA	1965	Kota Surabaya	Unggul	[9]
201019		Universitas Islam Negeri Sayyid Ali Rahmatullah	UIN SATU Tulungagung	2021	Kabupaten Tulungagung	Unggul	[10]
201023		Universitas Islam Negeri Kiai Haji Achmad Siddiq	UIN KHAS Jember	1997	Kabupaten Jember	Unggul	[11]
202035		Universitas Islam Negeri Kiai Ageng Muhammad Besari	UIN Kiai Ageng Muhammad Besari	2025	Kabupaten Ponorogo	Baik
202042		Universitas Islam Negeri Madura	UIN Madura	2025	Kabupaten Pamekasan	Baik
202045		Universitas Islam Negeri Syekh Wasil	UIN Syekh Wasil	2025	Kota Kediri	Baik

Kode PT	Logo	Nama	Singkatan	Tahun Berdiri	Lokasi	Akred.[4]	Tautan
002002		Institut Teknologi Sepuluh Nopember	ITS	1957	Kota Surabaya	Unggul	[12]

Kode PT	Logo	Nama	Singkatan	Tahun Berdiri	Lokasi	Akred.[4]	Tautan
005014		Politeknik Perkapalan Negeri Surabaya	PPNS	1987	Kota Surabaya	Unggul	[13]
005018		Politeknik Elektronika Negeri Surabaya	PENS	1986	Kota Surabaya	Unggul	[14]
005019		Politeknik Negeri Jember	POLIJE	1988	Kabupaten Jember	B	[15]
005023		Politeknik Negeri Malang	POLINEMA	2004	Kota Malang	B	[16]
005033		Politeknik Negeri Madura	POLTERA	2012	Kabupaten Sampang	Baik Sekali	[17]
005035		Politeknik Negeri Banyuwangi	POLIWANGI	2013	Kabupaten Banyuwangi	Baik Sekali	[18]
005036		Politeknik Negeri Madiun	PNM	2012	Kota Madiun	Baik Sekali	[19]
395003		Politeknik Kelautan dan Perikanan Sidoarjo	POLTEK KP Sidoarjo	1982	Kabupaten Sidoarjo	Baik Sekali	[20]
405016		Politeknik Kesehatan Kemenkes Surabaya	POLKESBAYA	2001	Kota Surabaya	Baik Sekali	[21]
405017		Politeknik Kesehatan Kemenkes Malang	POLKESMA	2001	Kota Malang	B	[22]
425009		Politeknik Pelayaran Surabaya	POLTEKPEL Surabaya	1982	Kota Surabaya	Baik	[23]
425010		Politeknik Penerbangan Surabaya	POLTEKBANG Surabaya	1989	Kota Surabaya	Baik Sekali	[24]
425017		Politeknik Perkeretaapian Indonesia	PPI Madiun	2014	Kota Madiun	Baik Sekali	[25]
445001		Politeknik Pembangunan Pertanian Malang	POLBANGTAN Malang	1986	Kabupaten Malang	Baik Sekali	[26]
475001		Politeknik Angkatan Darat	POLTEKAD	1988	Kota Batu	Baik Sekali	[27]

Kode PT	Logo	Nama	Singkatan	Tahun Berdiri	Lokasi	Akred.[4]	Tautan
243006		Sekolah Tinggi Agama Hindu Shantika Dharma Malang	STAH Shantika Dharma Malang	2001	Kota Malang	Belum Ada
473001		Sekolah Tinggi Teknologi Angkatan Laut	STTAL	1966	Kota Surabaya	B	[28]

Kode PT	Logo	Nama	Singkatan	Tahun Berdiri	Lokasi	Akred.[4]	Tautan
006001		Akademi Komunitas Negeri Pacitan	AKN Pacitan	2013	Kabupaten Pacitan	Baik	[29]
006002		Akademi Komunitas Negeri Putra Sang Fajar Blitar	AKB	2014	Kota Blitar	Baik	[30]
424009		Akademi Penerbang Indonesia	API Banyuwangi	2015	Kabupaten Banyuwangi	Baik	[31]
474003		Akademi Angkatan Laut	AAL	1951	Kota Surabaya	A	[32]

• Daftar perguruan tinggi swasta di Jawa Timur