Berikut daftar Kepala Daerah dan Wakil Kepala Daerah di 4 kabupaten/kota di Papua Selatan adalah:

Kabupaten/ Kota	Foto Bupati/ Wali Kota	Bupati/ Wali Kota		Foto Wakil Bupati/ Wali Kota	Wakil Bupati/ Wali Kota		Mulai Menjabat	Selesai Menjabat (Direncanakan)	Ref
Kabupaten Asmat Daftar Bupati/Wakil Bupati			Thomas Eppe Safanpo			Yoel Manggaprou	20 Februari 2025	20 Februari 2030	[1]
Kabupaten Boven Digoel Daftar Bupati/Wakil Bupati			Roni Omba			Marlinus	16 Oktober 2025	16 Oktober 2030	[2]
Kabupaten Mappi Daftar Bupati/Wakil Bupati			Kristosimus Yohanes Agawemu			Sanusi	20 Februari 2025	20 Februari 2030	[1]
Kabupaten Merauke Daftar Bupati/Wakil Bupati			Yoseph Bladib Gebze			Fauzun Nihayah	20 Februari 2025	20 Februari 2030	[1]

Catatan:

• "Mulai menjabat" merupakan tanggal pelantikan pada awal atau saat berlangsungnya periode kepemimpinan yang sedang berjalan. Untuk penjabat bupati/wali kota, merupakan tanggal pengangkatan atau perpanjangan sebagai penjabat bupati/wali kota.
• Berdasarkan putusan Mahkamah Konstitusi Nomor 27/PUU-XXII/2024 bahwa Gubernur dan Wakil Gubernur, Bupati dan Wakil Bupati, Wali kota dan Wakil Wali kota hasil pemilihan tahun 2020 menjabat sampai dengan dilantiknya Gubernur dan Wakil Gubernur, Bupati dan Wakil Bupati, serta Wali kota dan Wakil Wali kota hasil Pemilihan serentak secara nasional tahun 2024 sepanjang tidak melewati 5 (lima) tahun masa jabatan.

• Daftar kabupaten dan kota di Papua Selatan
• Papua Selatan
• Daftar Ketua DPRD Kabupaten/Kota di Papua Selatan
• Daftar gubernur dan wakil gubernur di Indonesia