Babak gugur Liga Champions UEFA 2002–2003 berlangsung dari 8 April 2003 hingga final di Old Trafford di Manchester, Inggris pada 28 Mei 2003. Babak gugur melibatkan delapan tim yang finis di dua teratas di masing-masing grup mereka di babak grup kedua.

Setiap pertandingan di babak gugur, selain final, dimainkan dalam dua leg, dengan masing-masing tim memainkan satu leg di kandang. Tim yang memiliki skor agregat lebih tinggi pada kedua leg akan maju ke babak berikutnya. Jika skor agregat berakhir sama rata, tim yang mencetak lebih banyak gol tandang dalam dua leg akan maju. Jika gol tandang juga sama, perpanjangan waktu 30 menit akan dimainkan. Jika ada gol yang dicetak selama perpanjangan waktu dan skor agregat masih imbang, tim tamu lolos dengan lebih banyak gol tandang yang dicetak. Jika tidak ada gol yang dicetak selama perpanjangan waktu, akan ada adu penalti setelah perpanjangan waktu.

Dalam pengundian perempat final, pertandingan dimainkan antara pemenang satu grup dan runner-up grup berbeda, dengan pemenang grup menjadi tuan rumah pada leg kedua.

Di final, pertandingan dimainkan hanya dalam satu leg di tempat netral. Jika skor imbang pada akhir waktu normal di final, kemudian 30 menit gol perak waktu tambahan diterapkan, di mana tim yang memimpin permainan pada jeda paruh waktu selama periode tambahan akan dinyatakan sebagai pemenang. Jika skor masih imbang setelah 15 menit awal perpanjangan waktu, permainan akan dilanjutkan selama 15 menit berikutnya. Jika tim masih seri, hasil seri ditentukan oleh adu penalti.

Waktunya adalah CEST (UTC+2) seperti yang dicantumkan oleh UEFA (waktu setempat ada dalam tanda kurung).

	Perempat final						Semi final						Final
	Real Madrid	3	3	6
	Manchester United	1	4	5
							Real Madrid	2	1	3
							Juventus	1	3	4
	Juventus (pw)	1	2	3
	Barcelona	1	1	2
													Juventus	0(2)
													Milan (p)	0(3)
	Ajax	0	2	2
	Milan	0	3	3
							Milan (a)	0	1	1
							[Inter Milan]]	0	1	1
	Inter Milan (a)	1	1	2
	Valencia	0	2	2

Tim 1	Agregat	Tim 2	Leg 1	Leg 2
Real Madrid	6–5	Manchester United	3–1	3–4
Juventus	3–2	Barcelona	1–1	2–1 (p.w.)
Ajax	2–3	Milan	0–0	2–3
Inter Milan	2–2 (a)	Valencia	1–0	1–2

8 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Ajax	0–0	Milan
	Laporan

Amsterdam Arena, Amsterdam

Penonton: 50,967

Wasit: Terje Hauge (Norwegia)

8 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Real Madrid	3–1	Manchester United
Figo 12' Raúl 28', 49'	Laporan	Van Nistelrooy 52'

Santiago Bernabéu, Madrid

Penonton: 74,663

Wasit: Anders Frisk (Swedia)

9 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Juventus	1–1	Barcelona
Montero 16'	Laporan	Saviola 78'

Stadio delle Alpi, Turin

Penonton: 48,783

Wasit: Ľuboš Micheľ (Slowakia)

9 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Inter Milan	1–0	Valencia
Vieri 14'	Laporan

San Siro, Milan

Penonton: 52,623

Wasit: Markus Merk (Jerman)

22 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Barcelona	1–2 (p.w.)	Juventus
Xavi 66'	Laporan	Nedvěd 53' Zalayeta 114'

Camp Nou, Barcelona

Penonton: 92,711

Wasit: Graham Poll (Inggris)

Juventus menang agregat 3–2.

22 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Valencia	2–1	Inter Milan
Aimar 7' Baraja 51'	Laporan	Vieri 5'

Mestalla, Valencia

Penonton: 43,802

Wasit: Kim Milton Nielsen (Denmark)

Agregat 2–2. Inter menang lewat gol tandang.

23 April 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Milan	3–2	Ajax
Inzaghi 30' Shevchenko 65' Tomasson 90+1'	Laporan	Litmanen 63' Pienaar 78'

San Siro, Milan

Penonton: 76,079

Wasit: Manuel Mejuto González (Spanyol)

Milan menang agregat 3–2.

23 April 2003

20:45
(19:45 UTC+1)

Manchester United	4–3	Real Madrid
Van Nistelrooy 43' Helguera 52' (b.d.) Beckham 71', 85'	Laporan	Ronaldo 12', 50', 59'

Old Trafford, Manchester

Penonton: 66,708

Wasit: Pierluigi Collina (Italia)

Real Madrid menang agregat 6–5.

Tim 1	Agregat	Tim 2	Leg 1	Leg 2
Real Madrid	3–4	Juventus	2–1	1–3
Milan	1–1 (a)	Inter Milan	0–0	1–1*

*Kedua tim Milan bermain di stadion yang sama (San Siro), namun Milan ditunjuk sebagai tim tandang pada leg kedua, dan menang melalui gol "tandang".

6 Mei 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Real Madrid	2–1	Juventus
Ronaldo 23' Roberto Carlos 73'	Laporan	Trezeguet 45'

Santiago Bernabéu, Madrid

Penonton: 74,773

Wasit: Terje Hauge (Norwegia)

7 Mei 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Milan	0–0	Inter Milan
	Laporan

San Siro, Milan

Penonton: 77,049

Wasit: Valentin Ivanov (Rusia)

13 Mei 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Inter Milan	1–1	Milan
Martins 84'	Laporan	Shevchenko 45+1'

San Siro, Milan

Penonton: 78,175

Wasit: Gilles Veissière (Perancis)

Agregat 1–1, Milan menang gol tandang.

14 Mei 2003

20:45
(20:45 UTC+2)

Juventus	3–1	Real Madrid
Trezeguet 12' Del Piero 43' Nedvěd 73'	Laporan	Zidane 89'

Stadio delle Alpi, Turin

Penonton: 65,377

Wasit: Urs Meier (Swiss)

Juventus menang agregat 4–3.

28 Mei 2003

19.45 BST

Juventus	0–0 (p.w.)	AC Milan
	Laporan
Adu penalti
Trezeguet Birindelli Zalayeta Montero Del Piero	2–3	Serginho Seedorf Kaladze Nesta Shevchenko

Old Trafford, Manchester

Penonton: 62,315^[1]

Wasit: Markus Merk (Jerman)